Балтийская академия туризма и предпринимательства была создана с целью подготовки и повышения кадров в области туризма. Началась история Балтийской академии туризма и предпринимательства с Зональных курсов Северо-Запада, которые были открыты  в 1969 году. Острая необходимость подготовки и повышения квалификации кадров в области туризма возникла в СССР в связи с тем, что в 70-е года прошлого века стремительно возрос интерес к туризму и путешествиям. Зональные курсы переросли в Балтийскую академию туризма и предпринимательства в 1991 году. Уже в следующем году на этой базе был открыт Балтийский международный институт туризма (БМИТ). Впервые подготовка кадров велась по специальности «Менеджмент» - «Менеджмент туристской индустрии». Первый выпуск состоялся в 1997 году – всего было выпущено 125 человек. В следующем году Балтийский международный институт туризма прошел государственную аккредитацию, после чего учебное заведение смогло выдавать дипломы государственного образца. Кроме этого, в 1998 году была открыта аспирантура по двум специальностям «Экономика предпринимательства» и «Экономика и управление народным хозяйством».

В 2000 году пост ректора заняла Тамара Ильинична Власова, которая прежде работала проректором по учебной и научной работе. Под ее руководством стали открываться новые специальности, вырос поток студентов, значительно увеличился профессорско-преподавательский состав. Благодаря высокому уровню научной работы и качественной подготовке аспирантов, в 2004 году в институте был открыт диссертационный совет по защите кандидатских, а еще через шесть лет – совет по защите докторских диссертаций по экономике.